Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms