Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDCA4Q9BXL8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CDCA4Q9BXL8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDCA4Q9BXL8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CDCA4Q9BXL8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDCA4Q9BXL8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDCA4Q9BXL8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDCA4Q9BXL8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDCA4Q9BXL8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDCA4Q9BXL8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDCA4Q9BXL8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDCA4Q9BXL8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CDCA4Q9BXL8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDCA4Q9BXL8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDCA4Q9BXL8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDCA4Q9BXL8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDCA4Q9BXL8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDCA4Q9BXL8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDCA4Q9BXL8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDCA4Q9BXL8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDCA4Q9BXL8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDCA4Q9BXL8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms