Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms