Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms