Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms