Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDCA7Q9BWT1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms