Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms