Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC30■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC30■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC30■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms