Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC2P3Q9BVR0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC2P3Q9BVR0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC2P3Q9BVR0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC2P3Q9BVR0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC2P3Q9BVR0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC2P3Q9BVR0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC2P3Q9BVR0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC2P3Q9BVR0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC2P3Q9BVR0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC2P3Q9BVR0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC2P3Q9BVR0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC2P3Q9BVR0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC2P3Q9BVR0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC2P3Q9BVR0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC2P3Q9BVR0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC2P3Q9BVR0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC2P3Q9BVR0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC2P3Q9BVR0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC2P3Q9BVR0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC2P3Q9BVR0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC2P3Q9BVR0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms