Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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UPK3BQ9BT76 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
UPK3BQ9BT76 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
UPK3BQ9BT76 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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