Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TINF2Q9BSI4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms