Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HINFPQ9BQA5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HINFPQ9BQA5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms