Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms