Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD5Q99666 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms