Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VAT1Q99536 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VAT1Q99536 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAT1Q99536 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms