Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
RSF1Q96T23 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
RSF1Q96T23 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
RSF1Q96T23 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
RSF1Q96T23 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
RSF1Q96T23 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
RSF1Q96T23 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
RSF1Q96T23 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
RSF1Q96T23 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
RSF1Q96T23 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
RSF1Q96T23 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC37.53■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
RSF1Q96T23 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
RSF1Q96T23 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms