Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms