Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms