Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms