Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF558Q96NG5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms