Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGD4Q96M96 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGD4Q96M96 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGD4Q96M96 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGD4Q96M96 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGD4Q96M96 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGD4Q96M96 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGD4Q96M96 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FGD4Q96M96 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms