Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms