Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms