Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EP400Q96L91 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EP400Q96L91 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EP400Q96L91 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EP400Q96L91 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EP400Q96L91 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EP400Q96L91 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EP400Q96L91 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EP400Q96L91 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EP400Q96L91 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EP400Q96L91 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EP400Q96L91 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EP400Q96L91 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EP400Q96L91 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EP400Q96L91 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EP400Q96L91 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EP400Q96L91 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EP400Q96L91 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EP400Q96L91 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EP400Q96L91 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EP400Q96L91 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
EP400Q96L91 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EP400Q96L91 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
EP400Q96L91 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EP400Q96L91 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EP400Q96L91 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EP400Q96L91 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EP400Q96L91 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EP400Q96L91 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EP400Q96L91 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.55■■■□□ 2
EP400Q96L91 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EP400Q96L91 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EP400Q96L91 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EP400Q96L91 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.55■■■□□ 2
EP400Q96L91 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EP400Q96L91 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EP400Q96L91 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.54■■■□□ 2
EP400Q96L91 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EP400Q96L91 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EP400Q96L91 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EP400Q96L91 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
EP400Q96L91 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EP400Q96L91 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EP400Q96L91 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EP400Q96L91 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EP400Q96L91 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EP400Q96L91 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EP400Q96L91 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EP400Q96L91 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EP400Q96L91 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EP400Q96L91 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EP400Q96L91 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
EP400Q96L91 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EP400Q96L91 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
EP400Q96L91 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EP400Q96L91 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EP400Q96L91 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
EP400Q96L91 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EP400Q96L91 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
EP400Q96L91 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EP400Q96L91 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.52■■■□□ 2
EP400Q96L91 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EP400Q96L91 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
EP400Q96L91 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.52■■■□□ 2
EP400Q96L91 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
EP400Q96L91 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.52■■■□□ 2
EP400Q96L91 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EP400Q96L91 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EP400Q96L91 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
EP400Q96L91 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EP400Q96L91 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms