Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms