Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY4

CPB2, Carboxypeptidase B2, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPB2Q96IY4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CPB2Q96IY4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPB2Q96IY4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPB2Q96IY4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPB2Q96IY4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPB2Q96IY4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPB2Q96IY4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CPB2Q96IY4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPB2Q96IY4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPB2Q96IY4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPB2Q96IY4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPB2Q96IY4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPB2Q96IY4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CPB2Q96IY4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPB2Q96IY4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPB2Q96IY4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms