Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms