Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHFRQ96EP1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHFRQ96EP1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHFRQ96EP1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHFRQ96EP1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHFRQ96EP1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHFRQ96EP1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHFRQ96EP1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHFRQ96EP1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHFRQ96EP1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHFRQ96EP1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHFRQ96EP1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHFRQ96EP1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHFRQ96EP1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CHFRQ96EP1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHFRQ96EP1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHFRQ96EP1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHFRQ96EP1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CHFRQ96EP1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHFRQ96EP1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHFRQ96EP1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHFRQ96EP1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHFRQ96EP1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHFRQ96EP1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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