Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG4CQ96DT6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms