Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms