Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CLUAP1Q96AJ1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLUAP1Q96AJ1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms