Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms