Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms