Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms