Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEIL2Q969S2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms