Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms