Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DPF3Q92784 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DPF3Q92784 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DPF3Q92784 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DPF3Q92784 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DPF3Q92784 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms