Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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RABGGTAQ92696 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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RABGGTAQ92696 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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