Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJA4Q8WW22 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJA4Q8WW22 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms