Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBLCP1Q8WVY7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms