Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms