Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA6DQ8NFY4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms