Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms