Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SPTSSBQ8NFR3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms