Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND94

LRRN4CL, LRRN4 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4CLQ8ND94 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN4CLQ8ND94 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN4CLQ8ND94 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms