Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms