Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNBD1Q8NA66 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNBD1Q8NA66 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms