Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G2

CMTR1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTR1Q8N1G2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CMTR1Q8N1G2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CMTR1Q8N1G2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CMTR1Q8N1G2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMTR1Q8N1G2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMTR1Q8N1G2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMTR1Q8N1G2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMTR1Q8N1G2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMTR1Q8N1G2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMTR1Q8N1G2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMTR1Q8N1G2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMTR1Q8N1G2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMTR1Q8N1G2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CMTR1Q8N1G2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMTR1Q8N1G2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMTR1Q8N1G2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMTR1Q8N1G2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMTR1Q8N1G2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms