Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GJD3Q8N144 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms