Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN4BQ8IWT1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN4BQ8IWT1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN4BQ8IWT1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN4BQ8IWT1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms